Il nome di San Marco, o meglio dei vassalli di San Marco, compare per la prima volta nel 1095, in un documento del conte normanno Enrico, che ne ingloba altri di diversi Catapani (nome dei governatori bizantini residenti a Troia, da cui deriva il nome della provincia di Foggia, Capitanata) riguardanti donazioni dei bizantini all'abbazia di San Giovanni de Lama, come allora si chiamava l'attuale convento di San Matteo.
La storia della nostra comunità è strettamente legata, perciò, a quella dell'antica abbazia benedettina, fondata, probabilmente, tra IX e X secolo e non, come spesso si dice, nel 567 dai Longobardi, che, tra l'altro, scesero in Italia nel 568.